Jel elektroforezi

Jel elektroforezi

Jel elektroforezi düzeneği – bu tampon çözelti dolu kutuya bir agaroz jel yerleştirilir ve arka kısımdaki güç kaynağı aracılığıyla elektrik akımı uygulanır. Negatif uç (siyah kablo) en uzak tarafta yer alır; bu sayede DNA, pozitif yüklü anoda (kırmızı kablo) doğru göç eder. Bu durumun nedeni, DNA parçalarındaki fosfat gruplarının negatif yüke sahip olmasıdır; bu gruplar negatif yüklü katot tarafından itilirken, pozitif yüklü anot tarafından çekilirler.
Sınıflandırma	Elektroforez
Diğer teknikler
İlgili	Kılcal elektroforez SDS-PAGE İki boyutlu jel elektroforezi Sıcaklık gradyanlı jel elektroforezi

Jel eletroforezi

Jel elektroforezi, saflaştırılmış nükleik asit ve proteinlerin molekül ağırlığı, miktarı ve alt tiplerinin saptanmasında yaygın olarak kullanılan moleküler bir inceleme yöntemidir.

Yöntemin avantajı; basit ve hızlı olmasının yanında diğer yöntemlerle yeterli düzeyde ayrılamayan nükleik asit parçacıklarının ayrılmasını sağlamasıdır.

En çok kullanılan jel elektroforezi yöntemleri agaroz jel elektroforezi ve poliakrilamid jel elektroforezidir. Nükleik asitler için genellikle agaroz jel, proteinler için ise poliakrilamid jel elektroforezi kullanılmaktadır.

SDS poliakrilamid jel elektroforezi (SDS-PAGE) hemen tüm protein tiplerinin analizinde uygulanabilmektedir.

Elektroforetik analiz elektriksel bir alanda, ortamda çözünmüş moleküllerin elektrik yüklerine göre göç etmeleri prensibine dayanır. Bu göç hızı molekülün büyüklüğüne, yapısına, ortamın yoğunluğuna, iyonik kuvvete ve uygulanan akıma bağlı olarak değişmektedir. Kullanılan molekülün jel üzerindeki yerini belirlemek için ortamda UV ışığı altında floresan etki gösteren etidyum bromürün (EB) veya benzeri bir ışıyıcı maddenin bulunması gerekmektedir.

Kaynakça

• Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler Kitabı. Editörler: Güler Temizkan, Nazlı Arda. İstanbul Üniversitesi, Biyoteknoloji ve Genetik Mühendisliği Araştırma ve Uygulama Merkezi (BİYOGEM) Yayın No: 1. Nobel Tıp Kitabevleri, 1999.