SARS-CoV-2 Omicron varyantı

Vikipedi, özgür ansiklopedi
1 Aralık 2021'de Nextstrain'den türetilen, genetik mesafeye göre radyal olarak ölçeklenen bir ağaçta gösterilen SARS-CoV-2'ninOmicron varyantı ve diğer önemli veya önceki endişe verici varyantları

Omicron varyantı (B.1.1.529), ilk olarak 24 Kasım 2021'de Güney Afrika'dan Dünya Sağlık Örgütü'ne (WHO) bildirilen SARS-CoV-2'nin (COVID-19'a neden olan) varyantıdır.[1][2]

Omicron, bronşlarda ( akciğer ve solunum yolları) Delta varyantından yaklaşık 70 kat daha hızlı çoğalır. Ancak kanıtlar, özellikle Delta varyantına kıyasla önceki suşlardan daha az şiddetli enfeksiyona neden olduğunu göstermektedir.[3][4] Omicron, derin akciğer dokusuna daha az nüfuz edebilir.[5] Omicron enfeksiyonları delta varyantından yüzde 91 daha az ölümcüldür ve yüzde 51 daha az hastaneye yatış riski vardır.[6] Bununla birlikte, içsel hastaneye yatış riskindeki tahmini fark, reinfeksiyonlar hariç tutulduğunda büyük ölçüde yüzde 0-30 düzeylerine düşmektedir.[7] Genel olarak, son derece yüksek yayılma oranı, hem çift doz aşılamadan hem de vücudun bağışıklık sisteminden kaçınma yeteneği ile birleştiğinde, herhangi bir zamanda hastanede bakıma ihtiyaç duyan toplam hasta sayısının hala büyük endişe kaynağı olduğu anlamına gelir.[5]

Aşılar, özellikle üçüncü doz bir mRNA aşısı sonrası ciddi hastalıklara ve hastaneye yatışlara karşı koruma sağlamaya devam etmektedir.[8][9] İlk rakamlar, çift aşılamanın enfeksiyona karşı yüzde 30 ila 40 ve hastaneye yatışa karşı yüzde 70 civarında koruma sağladığını gösteriyor. Yakın zamanda yapılan üçüncü bir aşı dozu, enfeksiyona karşı etkinliği yaklaşık yüzde 75'e ve ciddi hastalık için yüzde 88'e varan oranda yükseltir.[10]

Sınıflandırma[değiştir | kaynağı değiştir]

İsimlendirme[değiştir | kaynağı değiştir]

26 Kasım'da, DSÖ'nün SARS-CoV-2 Virüsünün Evrimi ile ilgili Teknik Danışma Grubu, PANGO soyu B.1.1.529'u endişe verici bir varyant olarak ilan etti ve Yunanca omicron harfiyle adlandırdı.[1][11] SARS-CoV-2'nin türevlerini tanımlamak için Yunan harfleri kullanılmaktadır. DSÖ, İngilizce "new" kelimesinin ve Çin soyadı Xi'nin benzerlikleriyle karıştırılmaması için Yunan alfabesinde önceki nu ve xi harflerini atladı.[11][12][13] Önceki isimlendirme, "ilgili varyant" Mu içindi.[14][15]

Muhtemelen bazı İngilizce konuşanlar arasında Yunan alfabesine aşinalık olmaması ve diğer yaygın konuşmalarda Latince " omni " önekinin göreceli sıklığı nedeniyle, varyantın adı da zaman zaman yanlış telaffuz edilmiş ve "Omnicron" olarak yanlış yazılmıştır.[16]

GISAID projesine GR / 484A kod tanımlayıcısı, Nextstrain projesine clade tanımlayıcısı 21K atandı.[17][18]

Mutasyonlar[değiştir | kaynağı değiştir]

SARS-CoV-2 Omikron varyantı,
Mutasyonların tanımlanması
Gen Amino asit
ORF1ab nsp3: K38R
nsp3: V1069I
nsp3: Δ1265
nsp3: L1266I
nsp3: A1892T
nsp4: T492I
nsp5: P132H
nsp6: Δ105-107
nsp6: A189V
nsp12: P323L
nsp14: I42V
Spike A67V
Δ69-70
T95I
G142D,
Δ143-145
Δ211
L212I
ins214EPE
G339D
S371L
S373P
S375F
K417N
N440K
G446S
S477N
T478K
E484A
Q493R
G496S
Q498R
N501Y
Y505H
T547K
D614G
H655Y
N679K
P681H
N764K
D796Y
N856K
Q954H
N969K
L981F
E T9I
m D3G
Q19E
A63T
n P13L
Δ31-33
R203K
G204R
Kaynaklar: Birleşik Krallık Sağlık Güvenliği Ajansı [19] Eş Varyantlar [18]

Varyant, bazıları sadece bilim adamlarının inceleme konusu olan birçok mutasyona sahiptir.[20] Omicron varyantı, referans/ata varyantına kıyasla toplam 60 mutasyona sahiptir: 50 adsız mutasyon, 8 eş anlamlı mutasyon ve 2 kodlamayan mutasyon.[21] Otuz iki mutasyon, enfeksiyonlar tarafından oluşturulan antikorların ve yaygın olarak uygulanan birçok aşının ana antijenik hedefi olan spike proteinini etkiler. Bu mutasyonların çoğu diğer suşlarda gözlemlenmemişti.[22][23] Varyant, orijinal virüsle karşılaştırıldığında, 30 amino asit değişikliği, üç küçük delesyon ve spike proteinde bir küçük ekleme ile karakterize edilir. Bunların 15'i reseptör bağlama alanında bulunur (rezidü 319-541). Ayrıca diğer genomik bölgelerde bir takım değişiklikler ve silinmeler taşır. Ek olarak, varyantın furin bölünme bölgesinde üç mutasyonu vardır.[24] Furin bölünme bölgesi SARS-CoV-2 enfektivitesini arttırır.[25] Genomik bölgeye göre mutasyonlar şunlardır:[26]

  • Spike proteini : A67V, Δ69-70, T95I, G142D, Δ143-145, Δ211, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A,498R,G50R,G104A,Q49R3S, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F
    • Bu 30 değişikliğin yarısı (15) reseptör bağlama alanı-RBD'de bulunur (rezidü 319-541)
  • ORF1ab
    • nsp3: K38R, V1069I, Δ1265, L1266I, A1892T
    • nsp4: T492I
    • nsp5: P132H
    • nsp6: Δ105-107, A189V
    • nsp12: P323L
    • nsp14: I42V
  • Zarf proteini : T9I
  • Zar proteini : D3G, Q19E, A63T
  • Nükleokapsid proteini : P13L, Δ31-33, R203K, G204R

HIV enfeksiyonu ile bir bağlantı, Omicron varyantının dizisindeki çok sayıda mutasyonu açıklayabilir.[27] Bakıldığı zaman virüsün bu kadar çok sayıda mutasyondan etkilenebilmesi için, konakçısını öldürmeden veya yok edilmeden uzun süre evrimleşebilmiş olması gerekir. Böyle bir durum, bağışıklık sistemi zayıflamış ancak hayatta kalmak için yeterli tıbbi bakım alan kişilerde görülür.[28] Bu, nüfusun %20'sinden fazlasını temsil eden Güney Afrika'daki HIV hastalarında görülen bir durumdur.[29] Kliniklere erişim eksikliği, damgalanma korkusu ve sağlık hizmetlerinin kesintiye uğraması nedeniyle bölgede HIV ile yaşayan milyonlarca kişi etkili HIV tedavisi alamıyor. HIV'in önlenmesi, Covid varyantlarının ortaya çıkmasına neden olan kontrolsüz HIV riskini azaltmanın anahtarı olabilir.[30]

Ayrıca 9 nükleotid dizisinden oluşan bu birçok mutasyondan birinin soğuk algınlığından sorumlu başka bir koronavirüsten (HCoV-229E olarak bilinir) alınmış olabileceği düşünülmektedir.[31] Bu hiç beklenmedik bir durum değildir; zaman zaman, vücuttaki virüsler genetik materyal segmentlerini birbirlerinden alır ve değiştirir ve bu yaygın bir mutasyon şeklidir.[31]

Yeni mutasyonları açıklamak için d,ğer bir hipoteze göre SARS-CoV-2'nin insanlardan farelere bulaştığı ve insanları yeniden enfekte etmeden önce 2020'nin ortaları ile 2021'in sonları arasında bir fare popülasyonunda mutasyona uğradığıdır.[32]

Alt soylar ve BA.2 alt varyantı[değiştir | kaynağı değiştir]

Araştırmacılar, Omicron'un üç alt soyunun varlığını belirlediler. 'Standart' sublineage hemen BA.1 /B.1.1.529.1 olarak adlandırılır, ve diğer iki sublineages BA.2 /B.1.1.529.2 ve BA.3 /B.1.1.529.3 şekilde bilinmektedir .[33] Bunlar mutasyonu paylaşırlar, ancak önemli ölçüde farklılık gösterirler. BA.1 ve BA.2 32 mutasyonunu paylaşır, ancak 28 de farklılık gösterir.[34] Bu durum onları diğer bazı ana varyantlar kadar farklı kılmaktadır.[35] BA.2'nin Yunan alfabesine dayalı olarak kendi adını alması önerilmiştir.[34]

'Standart' alt değişken ile BA.2 arasındaki dikkate değer bir fark, ikincisinin karakteristik S-geni hedef başarısızlığına (SGTF) neden olan silmeye (Δ69-70) sahip olmamasıdır. Bu sayede birçok qPCR testi bir vakayı daha önce baskın olan Delta varyantından ayrıştırarak hızlı bir şekilde tespit edebilir.[36][37] Bu nedenle, tespit için öncelikle SGTF'ye güvenen ülkeler BA.2'yi gözden kaçırabilirler.[36] İngiliz makamları, Omicron'un yayılmasını izlemek için tek başına SGTF'yi yetersiz olarak görmektedir.[38] Bu durum 'Gizli Omicron' tanımlamasıyla sonuçlanmıştır.[38] Yine de normal tam sıralama veya diğer bazı mutasyonların kontrolleri yoluyla tespit edilebildiğinden bu takma ad yanlıştır.[34] Danimarka ve Japonya gibi bazı ülkeler, L452R dahil olmak üzere çeşitli mutasyonları test eden bir qPCR varyantı kullanır.[39][40] Ayrıca L452R'ye sahip Delta'yı [41] ve L452R'ye sahip olmayan tüm Omicron alt dizilerini ayırt edebilirler.[42][43] Üçüncü Omicron alt dizisi BA.3 çok nadirdir ve BA.1'e benzer şekilde SGTF silinmesine (Δ69-70) sahip olduğundan saptamada aynı potansiyel sorunu içermemektedir.[44][45]

19 Aralık 2021 itibarıyla BA.2, PANGOLİN veritabanına yüklenen yarım düzine ülke verisine göre nispeten az sayıda diziyle nadir gözüküyordu.[33] Aralık 2021 sonu/Ocak 2022 başlarında, Hindistan'ın en azından bazı bölgelerinde baskın hale geldiği görülüyor (Aralık 2021 sonunda Kalküta'da [46] ) ve Filipinler, İskandinavya, Güney Afrika'da sıklaştı ve Singapur, Almanya ve Birleşik Krallık'ta artma belirtileri gösteriyordu.[47][48][49][50] 24 Ocak itibarıyla tüm uluslararası seyahat edenlerin karantinaya alındığı ve ayrıntılı taramasının yapıldığı Japonya'da BA.2'nin büyük çoğunluğunun Hindistan veya Filipinler'den gelen ve öyküleri en az 1 Aralık 2021'e kadar giden kişilerde tespit edildiği, ancak diğer ülkelerden gelen insanlarda da az sayıda tespit edilmiştir.[40][51][52] Danimarka'da ilk BA.2, 5 Aralık 2021'de alınan bir örnekteydi ve takip eden dönemde çok azı bulundu.[53] Elli hafta sonrasına kadar (13–19 Aralık) artmaya başlamıştı, BA.2 sıralı vakaların yaklaşık yüzde 2'sindeydi ve yüzde 46'sı BA.1 (kalan Delta)idi. Her iki Omicron alt varyantının sıklığı Aralık ayının son yarısı boyunca artmaya devam etti; elli iki haftada (27 Aralık-2 Ocak), BA.2 yüzde 20'ye ulaşmıştı ve BA.1 yüzde 72 ile zirveye ulaştı. Ocak 2022'de BA.1 düşmeye başlarken BA.2 artışını sürdürdü. 2022'nin ikinci haftasında (10-16 Ocak) ikisinin sıklığı neredeyse eşitti, her ikisi de marjinal olarak yüzde 50'nin altındaydı (yaklaşık yüzde biri hızla kaybolan Deltaydı).[53] Sonraki hafta, BA.2 alt varyantı olan yeni vakaların yüzde 65'i ile Danimarka'da BA.2 baskın hale geldi.[54] Diğer İskandinav ülkelerinden, Hindistan, Güney Afrika ve Birleşik Krallık'tan gelen eğilimler de BA.2'nin orijinal BA.1 ile orantılı olarak arttığını gösteriyordu.[55][56] 24 Ocak itibarıyla, Danimarka sağlık otoriteleri BA.1 ve BA.2 arasında hastaneye yatış veya ciddiyet açısından farklılıklar görmemişti ve Hindistan'dan gelen erken veriler aynı yöne işaret ediyordu.[38][54][57] Norveç çalışmaları, üst solunum yollarındaki virüs miktarının BA.1 ve BA.2 ile enfekte olanlarda benzer olduğunu göstermektedir.[56] Norveç'te, BA.2 ile enfekte olmuş birkaç kişi daha önce BA.1 ile enfekte olmuştu.[57] Danimarka'da, ön veriler, daha önce aşılanmış veya COVID-19 ile enfekte olmuş kişilerde ilerleme oranlarının BA.1 için görülen ilerleme ve yeniden enfeksiyon oranlarına benzer olduğunu göstermektedir [54] ancak daha fazla çalışma gereklidir.[58] Çalışmalar Danimarka Statens Serum Enstitüsü tarafından yürütülmekte ve ayrıca Birleşik Krallık Sağlık Güvenliği Kurumu tarafından da araştırılmaktadır.[35][59] 17 Ocak 2022 itibarıyla, BA.2 en az 40 ülkede ve Antarktika hariç tüm kıtalarda tespit edilmiştir.[43][59]

Olası sonuçlar[değiştir | kaynağı değiştir]

DSÖ, çok sayıda mutasyonun daha önce enfekte olmuş kişilerde ve aşılanmış kişilerde bağışıklığı azaltabileceğinden endişe duymaktadır. Omicron varyantının bu açıdan önceki varyantlardan daha bulaşıcı olması da mümkündür. Mutasyonların etkileri, varsa, Kasım 2021 sonu itibarıyla bilinmemektedir. DSÖ, özellikle ölüm ve hastalık oranlarının çok daha yüksek olabileceği aşılama oranlarının düşük olduğu ülkelerde sağlık hizmetlerinin yetersiz kalabileceği konusunda uyarıyor ve tüm ülkeleri COVID-19 aşılarını artırmaya çağırıyor.[60]

Cardiff Üniversitesi'nde immünolog olan Profesör Paul Morgan da aşı yapılmasını önermedktedir. Morgan, "Bence tam bir bağışıklık kaybından ziyade körelme en olası sonuçtur. Virüs yüzeyindeki her bir epitopu kaybedemez, çünkü eğer yapsaydı spike proteini daha fazla çalışamazdı. Bu nedenle, virüsün önceki sürümlerine veya aşılara karşı oluşan antikorların ve T hücresi klonlarının bazıları etkili olmayabilirken, etkili olmaya devam edecek olanlar da olacaktır. (...) Bağışıklık yanıtının yarısı ya da üçte ikisi ya da her neyse, etkili olmayacaksa ve kalan yarısı ile kalırsanız, o zaman bu kısmı kadar çok artırılırsa o kadar iyidir." [61]

University College London'daki Genetik Enstitüsü'nden Profesör Francois Balloux, "Şu ana kadar öğrendiklerimize göre, diğer varyantlarla karşılaştırıldığında, Omicron'un daha önce enfekte olmuş ve virüs bulaşmış insanları yeniden enfekte etme eğiliminde olduğundan oldukça emin olabiliriz. Bu oldukça açık ve protein yapısında saptadığımız mutasyonel değişikliklerden bekleniyordu. Bunlar, antikorların virüsü nötralize etmesini zorlaştırıyor." [62]

15 Aralık 2021'de Avrupa Hastalık Önleme ve Kontrol Merkezi, varyantın Delta'dan daha hafif olduğu ortaya çıksa bile, artan bulaşıcılığın neden olduğu vakalardaki katlanarak büyüme nedeniyle yayılmasının hastaneye yatışları ve ölümleri büyük olasılıkla artıracağını değerlendirdi.

23 Aralık 2021'de Nature, Omicron'un aşı korumasını muhtemelen zayıflatmasına rağmen, şu anda mevcut aşılama ve güçlendirme yaklaşımlarıyla Omicron'a karşı makul etkinliğin korunabileceğini belirtiyor.[63][64]

Belirti ve bulgular[değiştir | kaynağı değiştir]

Hastalık Kontrol Merkezi tarafından 1 ile 7 Aralık tarihleri arasında gerçekleştirilen bir çalışmada, "En yaygın olarak bildirilen semptomlar öksürük, yorgunluk ve burun tıkanıklığı ve akıntısıydı" ve bu da daha az zarar veren bir varyanttan veya başka bir virüsten ayırt edilmesini zorlaştırıyordu.[65]

25 Aralık 2021'de Londra'da yayınlanan araştırma, Zoe Covid uygulaması kullanıcıları tarafından en sık belirtilen semptomların "burun akıntısı, baş ağrısı, yorgunluk, hapşırma ve boğaz ağrısı" olduğunu öne sürdü.

Omicron varyantının yeni ve sık görülmeyen bir semptomu ise gece terlemeleridir .

Özellikleri[değiştir | kaynağı değiştir]

Spike proteindeki mutasyonların çoğu, endişe duyulan diğer varyantlarda mevcuttur ve artan enfeksiyon ve antikordan kaçma ile ilişkilidir. Hesaplamalı modelleme, varyantın hücre aracılı bağışıklıktan da kaçabileceğini düşündürmektedir.[23] 26 Kasım'da ECDC , olası bağışıklık kaçışını görmek için nekahat dönemindeki serumların ve aşıların nötralize etme kapasitesinin değerlendirilmesinin acilen gerekli olduğunu ve bu verilerin iki ila üç hafta içinde beklendiğini söyledi.[26]

Bulaşıcılık[değiştir | kaynağı değiştir]

Varyantın yüksek düzeyde bağışıklığa sahip popülasyonlarda nasıl yayılacağı Kasım 2021'de bilinmiyordu. Omicron varyantının daha hafif veya daha şiddetli bir COVID-19 enfeksiyonuna neden olup olmadığı da bilinmiyordu. İlaç şirketlerine göre aşılar, gerekirse "yaklaşık 100 gün içinde" varyantla mücadele etmek için güncellenebilirdi.[66]

Doğal olarak kazanılmış bağışıklıkla ilgili olarak, Ulusal Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü'nde uzman olan Anne von Gottberg, Aralık 2021'in başında, önceki varyantlar tarafından verilen bağışıklığın Omicron'a karşı koruma sağlamayacağına bildiriyordu.[67]

15 Aralık 2021'de Birleşik Krallık Sağlık Güvenliği Ajansı başkanı Jenny Harries bir meclis komitesine, ülkenin yüksek aşılama oranına rağmen Birleşik Krallık'ın çoğu bölgesinde COVID-19'un iki katına çıkma süresinin iki günden az olduğunu söyledi. COVID-19'un Omicron varyantının "pandeminin başlangıcından bu yana muhtemelen en önemli tehdit" olduğunu ve önümüzdeki birkaç gündeki vaka sayısının "nüfusumuzun büyüme hızımıza kıyasla oldukça şaşırtıcı" olacağını ve "önceki varyantlar için vakalar görüldüğünü"dile getirdi.[68]

Virülans[değiştir | kaynağı değiştir]

28 Kasım 2021 itibarıyla Dünya Sağlık Örgütü'nün güncellemesi şöyle diyor: "Şu anda Omicron ile ilişkili semptomların diğer varyantlardan farklı olduğunu gösteren hiçbir bilgi yok... ". Güney Afrika'da artan hastaneye yatış oranları, Omicron varyantının herhangi bir özel özelliğinden ziyade daha fazla sayıda vakaya bağlı olabilir[69]

4 Aralık 2021'de Güney Afrika Tıbbi Araştırma Konseyi, 14-29 Kasım 2021 tarihleri arasında Tshwane'deki bir hastane kompleksinde yatan hastaların önceki dalgalara göre daha genç olduğunu ve yoğun bakım ve oksijen tedavisi oranlarının önceki dalgalardan daha düşük olduğunu bildirdi. Bu gözlemler kesin değildir ve klinik profil takip eden iki hafta içinde değişebilir ve bu da hastalığın şiddeti hakkında daha doğru sonuçlara olanak tanır.[70] Aşırı ölümler 28 Kasım haftasında neredeyse iki katına çıktı ve bu da yetersiz raporlama olduğunu gösteriyor. Ancak seviye hala 2021 Ocak ortasındaki ikinci dalgada görülenden çok daha düşüktü.[71] 12 Aralık'ta Dünya Sağlık Örgütü genel müdürü Tedros Adhanom , insanların Omicron'u hafif olarak görmelerinin yanlış olduğunu iddia etti. Bunun nedeni, Güney Afrika'da önceki enfeksiyonlara yüksek düzeyde maruz kalmanın muhtemelen yeni enfeksiyonların klinik seyrini etkilemesidir.[72]

20 Aralık'ta Imperial College COVID-19 Müdahale Ekibi tarafından İngiltere'den alınan verilere dayanan bir rapor, hastaneye yatış ve asemptomatik enfeksiyon göstergelerinin Omicron enfeksiyonu ile anlamlı bir şekilde ilişkili olmadığını ve Delta ile karşılaştırıldığında şiddette en sınırlı değişiklik olduğunu ortaya koydu. 22 Aralık'ta ekip, Delta varyantına kıyasla en az 1 gece kalmayı gerektiren hastaneye yatış riskinin yaklaşık% 41 (% 95 CI,% 37-45) daha düşük olduğunu ve verilerin 2 doz Pfizer–BioNTech, Moderna veya Oxford–AstraZeneca aşısı olanların hastaneye yatıştan önemli ölçüde korunduğunu öne sürdüğünü bildirdi.

Teşhis[değiştir | kaynağı değiştir]

FDA, PCR testlerinin Omicron'dan nasıl etkileneceğine dair yönergeler yayınladı.[73] Birden fazla gen hedefini tespit eden testler, testi COVID-19 için pozitif olarak tanımlamaya devam edecektir. Omicron'u Delta'dan ayırmanın kestirme bir yolu olarak S-gen düşüşü veya hedef başarısızlığı önerilmiştir. Varyant, dizileme ve genotipleme ile de tanımlanabilir.[74]

Önleme[değiştir | kaynağı değiştir]

Diğer varyantlarda olduğu gibi, WHO, insanların kapalı alanları iyi havalandırılmaya devam etmesini, kalabalıktan ve yakın temastan kaçınmasını, iyi oturan maskeler takmasını, sık sık elleri temizlemesini ve aşı olmasını tavsiye etti.[1][75]

26 Kasım 2021'de BioNTech, mevcut aşının varyanta karşı etkili olup olmadığını iki hafta içinde öğreneceğini ve gerekirse güncellenmiş bir aşının 100 gün içinde gönderilebileceğini söyledi. AstraZeneca, Moderna ve Johnson & Johnson da varyantın aşılarının etkinliği üzerindeki etkisini inceliyorlardı.[76] Aynı gün Novavax, şirketin birkaç hafta içinde test ve üretime hazır olmasını beklediği Omicron varyantı için iki doz gerektiren güncellenmiş bir aşı geliştirdiğini belirtti.[77][78] 29 Kasım 2021'de Gamaleya Enstitüsü, Sputnik Light'ın varyanta karşı etkili olması gerektiğini, Sputnik V'i uyarlamaya başlayacağını ve modifiye edilmiş bir versiyonun 45 gün içinde seri üretime hazır olabileceğini söyledi.[79] Sinovac, varyanta karşı inaktive edilmiş bir aşıyı hızlı bir şekilde seri üretebileceğini ve yeni bir aşıya ihtiyaç olup olmadığını belirlemek için varyantın çalışmalarını izlediğini ve örneklerini topladığını söyledi.[80] 7 Aralık 2021'de, ortağı Instituto Butantan ile Brezilya'da düzenlenen bir sempozyumda Sinovac, aşısını yeni varyanta güncelleyeceğini ve üç ay içinde kullanıma sunacağını söyledi [81] 2 Aralık'ta Finlay Enstitüsü, varyanta karşı zaten Soberana Plus'ın bir versiyonunu geliştiriyordu.[82]

29 Kasım 2021'de DSÖ, aşılananlar arasında küçük ve öngörülebilir bir oranda da olsa vaka ve enfeksiyonların beklendiğini söyledi.[83]

7 Aralık 2021'de Durban'daki Afrika Sağlık Araştırma Enstitüsü'nde Pfizer-BioNTech aşısını alan 12 kişiyle yapılan bir laboratuvar testinden elde edilen ön sonuçlar, bazı örneklerde varyanta karşı antikor aktivitesini nötralize etmede 41 kat azalma buldu. Bu büyük bir azalmadır, ancak varyantın aşılardan tamamen kurtulabileceği anlamına gelmez, bu nedenle mevcut aşılarla aşılama hala önerilir. Varyanta karşı nötralize edici antikor aktivitesi, yaklaşık bir yıl önce enfekte olduktan sonra tam olarak aşılananlarda daha fazlaydı. Daha fazla veri toplandıkça etkinlik tahminleri muhtemelen değişecektir, çünkü aşılama ile üretilen antikorlar bireyler arasında büyük farklılıklar gösterir ve örneklem küçüktü.[84][85][86] 8 Aralık 2021'de Pfizer ve BioNTech, ön verilerin üçüncü bir aşı dozunun, iki dozdan sonra diğer varyantlara karşı görüldüğü gibi varyanta karşı benzer düzeyde nötralize edici antikorlar sağlayacağını gösterdiğini bildirdi.

10 Aralık 2021'de Birleşik Krallık Sağlık Güvenliği Ajansı, erken verilerin, önceki suşlara göre Pfizer 2 doz aşılardan elde edilen serumlarla Omicron için nötralize edici aktivitede 20 ila 40 kat ve Delta'ya göre 20 kat azalma gösterdiğini bildirdi. AstraZeneca 2 doz aşılardan elde edilen serumlarda antikorlarda azalma vardı. Bir mRNA takviye dozu, birincil aşılama için kullanılan aşıdan bağımsız olarak, nötralize edici aktivitede benzer bir artış üretti. Bir destek dozundan sonra (genellikle bir mRNA aşısı ile),[87] semptomatik hastalığa karşı aşı etkinliği 70–75 ve şiddetli hastalığa karşı etkinliğin daha yüksek olması bekleniyordu.

26 Kasım 2021'de DSÖ, uluslardan aşağıdakileri yapmalarını istedi:

  • Dolaşan SARS-CoV-2 varyantlarını daha iyi anlamak için gözetim ve sıralama çabalarını geliştirin.
  • Tam genom dizilerini ve ilişkili meta verileri GISAID gibi herkese açık bir veritabanına gönderin.
  • Endişe verici virüs enfeksiyonuyla ilişkili ilk vakaları/kümeleri UST mekanizması aracılığıyla DSÖ'ye bildirin.
  • Kapasitenin mevcut olduğu durumlarda ve uluslararası toplumla koordineli olarak, endişe konusu COVID-19 virüsünün epidemiyolojisi, şiddeti ve halk sağlığı ve sosyal önlemlerin, teşhis yöntemlerinin etkinliği üzerindeki potansiyel etkilerinin anlaşılmasını geliştirmek için saha araştırmaları ve laboratuvar değerlendirmeleri gerçekleştirin, bağışıklık tepkileri, antikor nötralizasyonu veya diğer ilgili özelliklere odaklanın.[88]

Tedavi[değiştir | kaynağı değiştir]

Deksametazon gibi kortikosteroidlerin ve tocilizumab (Actemra) gibi IL6 reseptör blokerlerinin, daha önceki şiddetli COVID-19 suşları olan hastaları yönetmede etkili olduğu bilinmektedir. Diğer tedavilerin etkinliği üzerindeki etkiler 2021'de değerlendiriliyordu.[89][90]

Monoklonal antikorlar (mAb'ler) tedavileriyle ilgili olarak benzer testler ve araştırmalar devam etmektedir. İn vitro psödotipli virüs verilerine ilişkin klinik öncesi veriler, yüksek oranda korunmuş epitopları kullanmak üzere tasarlanmış bazı mAb'lerin, Omicron ikamelerinin anahtar mutasyonlarına karşı nötralize edici aktiviteyi koruduğunu göstermektedir. Benzer sonuçlar, kriyo-elektron mikroskobu ve X-ışını verileriyle de doğrulanır; ayrıca, Omikron antijenik kayması ile sergilenen humoral bağışıklığın kaçırılması için yapısal yaklaşım ve moleküler temelin yanı sıra aşı ve terapötik tasarım için korunmuş epitopların hedeflenmesinin önemini sağlar. 7 klinik mAb veya mAb kokteyli, prototipik virüse göre 1-2 büyüklük veya daha fazla büyüklükte nötrleştirici aktivite kaybı yaşarken, sotrovimab'ın ana mAb'si olan S309 mAb, Omicron'u sadece 2-3 kat azaltılmış potens ile nötralize etti. Daha fazla veri, Omicron'un önemli miktarda hümoral bağışıklık kaçırmaya neden olacağını ve sarbekovirüsle korunan bölgeyi hedef alan nötralize edici antikorların en etkili olmaya devam ettiğini gösteriyor.[91] Aslında, çoğu reseptör bağlama motifine (RBM) yönelik monoklonal antikorlar, Omicron'a karşı in vitro nötralize edici aktiviteyi kaybetti. Başka bir çalışmada incelenen 29 mAb'den sadece 3'ü değişmemiş potensi korudu. Ayrıca, geniş ölçüde nötralize edici sarbekovirüs mAb'lerinin bir kısmı, sotrovimab (VIR-7831), S2X259 ve S2H97 dahil olmak üzere RBM dışındaki antijenik bölgelerin tanınması yoluyla Omicron'u nötralize etti.[92]

Epidemiyoloji[değiştir | kaynağı değiştir]

26 Kasım 2021'de Güney Afrika Ulusal Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü 30.904 COVID testinin (bir günde) 2.828 yeni COVID enfeksiyonu (%9.2 pozitiflik oranı) tespit ettiğini duyurdu. Bir hafta sonra, 3 Aralık 2021'de NİCD, 65.990 COVID testinin 16.055 yeni enfeksiyon bulduğunu (yedi gün öncesine göre 5.7 kat daha fazla; pozitif oran% 24.3) ve bunların yüzde 72'sinin Gauteng'de bulunduğunu açıkladı. Güney Afrika'nın bu eyaleti, km2 başına yaklaşık 850 nüfuslu yoğun bir bölgedir. Gauteng'in başkenti Johannesburg ise bir metropoldür (şehrin kendisinde yaklaşık 5.5 milyon kişi artı kentsel bölgede 9.5 milyon kişi).

Kasım 2021'de, Delta varyantı veya COVID-19 virüsünün diğer varyantları ile karşılaştırıldığında Omicron varyantının bulaşabilirliği hala belirsizdi.[93] Omicron sıklıkla daha önce Covid pozitif olan insanlara bulaşabilir.[94][95]

Omicron genom karşılaştırmalarına dayanarak, Omicron varyantının Eylül ayı sonlarında veya Ekim 2021 başlarında ayrıldığı tahmin edilmektedir.[96] Sıralama verileri, Omicron'un ülkede ilk tanımlandığı ay olan Kasım 2021'e kadar Güney Afrika'da baskın varyant haline geldiğini gösteriyor.[97][98]

Filogeni yakın zamanda ortaya çıkan bir durumu düşündürür. Güney Afrika'dan gelen veriler, Omicron'un orada belirgin bir büyüme avantajına sahip olduğunu gösteriyor. Ancak bu, bulaşıcılık veya bağışıklık kaçışına bağlı veya her ikisinden de kaynaklanabilir." [99]

Güney Afrika'nın Gauteng eyaletinden gelen atık su örneklerinde COVID-19 seviyelerinde tespit edilebilir değişiklikler 17-23 Ekim (42. hafta) gibi erken bir tarihte görüldü.[100] Ulusal Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü, Güney Afrika'daki Omicron keşif noktası Tshwane'de 2 yaşın altındaki çocukların toplam hastane başvurularının %10'unu oluşturduğunu bildiriyor.[101] Güney Afrika'da örneklenen vakaların S geni hedef başarısızlığına (SGTF) ilişkin veriler, Delta'ya göre günde %21'lik bir büyüme olduğunu ve 2,4 kat artan bir üreme sayısı oluşturduğunu göstermektedir. [a] Omicron, 10 Kasım civarında Güney Afrika'da çoğunluk suşu haline geldi.[102][103] Başka bir analiz, Güney Afrika'nın Gauteng kentinde 6 Kasım civarında baskın hale gelerek günde %32 büyüme gösterdiğini göstermiştir.[104]

13 Ocak 2022'de BBC, ABD ve Kanada'da hastaneye yatış oranının Avrupa ve Güney Afrika'dan daha yüksek olduğunu bildirdi. Bu, Güney Afrika'dakinden daha fazla sayıda yaşlı insanın bulunmasına, Avrupa'dakinden daha fazla hipertansiyon ve obezite gibi komorbidite prevalansına, kış nedeniyle iç mekanlarda daha yüksek bulaşmanın, ABD'de Avrupa ve Kanada'dan daha düşük aşılama oranının bir kombinasyonuna bağlandı. Ayrıca daha sıklıkla hastaneye yatışa yol açan Delta varyantının hala yüksek prevalansa sahipti.[105]

Kaynakça[değiştir | kaynağı değiştir]

  1. ^ a b c "Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern". World Health Organization. 26 Kasım 2021. 26 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Kasım 2021. 
  2. ^ "Omicron: a mysterious variant of concern". The European Physical Journal Plus (İngilizce). 137 (1): 100. 10 Ocak 2022. doi:10.1140/epjp/s13360-021-02321-y. ISSN 2190-5444. PMC 8743750 $2. PMID 35036269. 
  3. ^ "Coronavirus Resource Center - Harvard Health". Harvard Health Publishing. 6 Ocak 2022. 11 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Ocak 2022. Lab studies, animal studies, and epidemiological data all indicate that Omicron may cause less severe disease than previous variants. 
  4. ^ "Omicron Is Milder". The New York Times. 5 Ocak 2022. 6 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Ocak 2022. A few weeks ago, many experts and journalists were warning that the initial evidence from South Africa — suggesting that Omicron was milder than other variants — might turn out to be a mirage. It has turned out to be real. 
  5. ^ a b "Lung tissue study sheds light on fast Omicron spread". CIDRAP. 16 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 25 Aralık 2021. 
  6. ^ Lewnard (11 Ocak 2022). "Clinical outcomes among patients infected with Omicron (B.1.1.529) SARS-CoV-2 variant in southern California" (İngilizce): 2022.01.11.22269045. doi:10.1101/2022.01.11.22269045. 16 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Ocak 2022. 
  7. ^ "Some reduction in hospitalisation for Omicron v Delta in England: early analysis". Imperial College London. 22 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 22 Ocak 2022. 
  8. ^ "SARS-CoV-2 T Cell Responses Elicited by COVID-19 Vaccines or Infection Are Expected to Remain Robust against Omicron". Viruses. 14 (1): 79. January 2022. doi:10.3390/v14010079. 
  9. ^ "Diminished antibody response against SARS-CoV-2 Omicron variant after third dose of mRNA vaccine in kidney transplant recipients" (İngilizce). 6 Ocak 2022: 2022.01.03.22268649. doi:10.1101/2022.01.03.22268649. 11 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 16 Ocak 2022. 
  10. ^ "How Effective Are COVID-19 Vaccines Against Omicron?". Healthline (İngilizce). 7 Ocak 2022. 16 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Ocak 2022. 
  11. ^ a b "Coronavirus latest news: EU suspends all flights to southern Africa over omicron Covid variant fears". The Telegraph (İngilizce). 26 Kasım 2021. ISSN 0307-1235. 26 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Kasım 2021. 
  12. ^ "How Omicron, the New Covid-19 Variant, Got Its Name". The New York Times (İngilizce). 27 Kasım 2021. ISSN 0362-4331. 28 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Kasım 2021. 
  13. ^ "There are several COVID-19 variants you haven't heard of". NewsNation Now (İngilizce). 27 Kasım 2021. 27 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Kasım 2021. 
  14. ^ "Tracking SARS-CoV-2 variants". World Health Organization. 18 Haziran 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 13 Aralık 2021. 
  15. ^ "Countries are scrambling to stop a new covid variant". The Economist (İngilizce). 26 Kasım 2021. 26 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Kasım 2021. 
  16. ^ "'Omni is everywhere': why do so many people struggle to say Omicron?". The Guardian (İngilizce). 15 Aralık 2021. 23 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 23 Aralık 2021. 
  17. ^ "In focus". gisaid.org. GISAID. 28 Kasım 2021. 21 Ocak 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Kasım 2021. The unique mix of spike amino acid changes in Omicron GR/484A (B.1.1.529) is of interest as it comprises several that were previously known to affect receptor binding and antibody escape. 
  18. ^ a b "Variant: 21K (Omicron)". covariants.org. CoVariants. 28 Kasım 2021. 28 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Kasım 2021. Variant 21K (Omicron) appears to have arisen in November 2021, possibly in South Africa.  Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "CoVariants1" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: Kaynak gösterme)
  19. ^ "SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England - Technical briefing 29" (PDF). gov.uk. UK Health Security Agency. 26 Kasım 2021. s. 18. 27 Kasım 2021 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 10 Aralık 2021. 
  20. ^ "What we know so far about the B.1.1.529 'Omicron' COVID variant causing concern". Euronews. 26 Kasım 2021. 26 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Kasım 2021. 
  21. ^ William A. Haseltine (2 Aralık 2021). "Omicron Origins". Forbes. 3 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 4 Aralık 2021. 
  22. ^ "What we know about Omicron variant that has sparked global alarm". Financial Times. 26 Kasım 2021. 26 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Kasım 2021. 
  23. ^ a b "Heavily mutated Omicron variant puts scientists on alert". Nature. 600 (7887): 21. December 2021. doi:10.1038/d41586-021-03552-w. PMID 34824381. 26 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Kasım 2021.  Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "nature-alert" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: Kaynak gösterme)
  24. ^ "New Virus Variant Stokes Concern but Vaccines Still Likely to Work". The New York Times. 26 Kasım 2021. 26 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Kasım 2021. 
  25. ^ "Furin cleavage of the SARS-CoV-2 spike is modulated by O-glycosylation". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118 (47): e2109905118. November 2021. doi:10.1073/pnas.2109905118. PMC 8617502 $2. PMID 34732583. 
  26. ^ a b "Implications of the emergence and spread of the SARS-CoV-2 B.1.1.529 variant of concern (Omicron) for the EU/EEA" (PDF). ecdc.europa.eu. 26 Kasım 2021 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Kasım 2021. 
  27. ^ "The birth of Omicron: Did HIV play a role?". www.medicalnewstoday.com (İngilizce). 6 Aralık 2021. 15 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 11 Aralık 2021. 
  28. ^ "The mystery of where omicron came from — and why it matters". NPR. 1 Aralık 2021. 9 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 8 Aralık 2021. 
  29. ^ "HIV and AIDS in South Africa". Avert. 21 Temmuz 2015. 16 Ekim 2015 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 8 Aralık 2021. 
  30. ^ "Why uncontrolled HIV may be behind the emergence of Omicron". The Guardian (İngilizce). 11 Aralık 2021. 20 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 12 Aralık 2021. 
  31. ^ a b "Fact Check-Omicron is not the common cold 'rebranded'". Reuters. 10 Aralık 2021. 21 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 25 Aralık 2021 – www.reuters.com vasıtasıyla. 
  32. ^ "Evidence for a mouse origin of the SARS-CoV-2 Omicron variant". Journal of Genetics and Genomics = Yi Chuan Xue Bao. December 2021. doi:10.1016/j.jgg.2021.12.003. PMC 8702434 $2. PMID 34954396. 
  33. ^ a b "Lineage B.1.1.529". PANGOLIN. 19 Aralık 2021. 20 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 19 Aralık 2021. 
  34. ^ a b c "What is 'stealth Omicron'? The rise of the subvariant is alarming some scientists who say it needs its own Greek letter". Fortune. 21 Ocak 2022. 23 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 23 Ocak 2022.  Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "For 21Jan2022" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: Kaynak gösterme)
  35. ^ a b "En subvariant af omikron, BA.2, udgør nu knap halvdelen af alle danske omikrontilfælde" [A subvariant of Omicron, BA.2., now comprises almost half of all Danish Omicron cases] (Danca). Statens Serum Institut. 19 Ocak 2022. 20 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Ocak 2022.  Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "SSI 19Jan2022" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: Kaynak gösterme)
  36. ^ a b "Scientists find 'stealth' version of Omicron that may be harder to track". www.theguardian.com. 7 Aralık 2021. 7 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Aralık 2021. 
  37. ^ "Stealth Omicron: What is The Fast Spreading Omicron BA.2 Sub-Variant That Can Escape RT-PCR Test?". india.com. 23 Ocak 2022. 23 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 23 Ocak 2022. 
  38. ^ a b c "Government scientists monitoring new BA.2 variant of Omicron". Yahoo News. 21 Ocak 2022. 21 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Ocak 2022.  Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "YNews 21Jan2022" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: Kaynak gösterme)
  39. ^ "Variant-PCR-testen (tidl. Delta-PCR-testen)" (Danca). Statens Serum Institut. 21 Aralık 2021. 7 Şubat 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Ocak 2022. 
  40. ^ a b "SARS-CoV-2の変異株B.1.1.529系統(オミクロン株)について(第6報)" (Japonca). National Institute of Infectious Diseases (Japan). 14 Ocak 2022. 20 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Ocak 2022.  Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "Jpn 14Jan2022" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: Kaynak gösterme)
  41. ^ "Delta Variant Report". outbreak.info (Scripps Research). 13 Aralık 2021. 19 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 13 Aralık 2021. 
  42. ^ "BA.1 Lineage Report". outbreak.info (Scripps Research). 19 Aralık 2021. 16 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 19 Aralık 2021. 
  43. ^ a b "BA.2 Lineage Report". outbreak.info (Scripps Research). 21 Ocak 2022. 13 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Ocak 2022.  Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "OBI BA2" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: Kaynak gösterme)
  44. ^ "Lineage BA.3". PANGOLIN. 25 Ocak 2022. 16 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 25 Ocak 2022. 
  45. ^ "BA.3 Lineage Report". outbreak.info (Scripps Research). 19 Aralık 2021. 20 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 19 Aralık 2021. 
  46. ^ "BA.2 'stealth' variant makes up 80% of Kolkata's Omicron infections". The Times of India. 11 Ocak 2022. 16 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Ocak 2022. 
  47. ^ "Omicron 'sub-lineage' BA.2 designated as COVID variant under investigation, says UKHSA". Sky News. 21 Ocak 2022. 21 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Ocak 2022. 
  48. ^ "SARS-CoV-2 Sequencing Update 14 January 2022" (PDF). Network for Genomic Surveillance in South Africa. 14 Ocak 2022. 17 Ocak 2022 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Ocak 2022. 
  49. ^ "Omicron sub-variant BA.2 'under investigation' by UK health officials". The Independent. 23 Ocak 2022. 23 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 23 Ocak 2022. 
  50. ^ "Undergrupp av omikron ökar: "Kan vara ännu mer smittsam"" (İsveççe). Aftonbladet. 11 Ocak 2022. 11 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Ocak 2022. 
  51. ^ "新型コロナウイルス感染症(変異株)の患者等の発生について(空港検疫))" (Japonca). National Institute of Infectious Diseases (Japan). 20 Ocak 2022. 20 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Ocak 2022. 
  52. ^ "新型コロナウイルス感染症(変異株)の患者等の発生について(空港検疫)" (Japonca). National Institute of Infectious Diseases (Japan). 24 Ocak 2022. 24 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Ocak 2022. 
  53. ^ a b "Genomic overview of SARS-CoV-2 in Denmark". Danish Covid-19 Genome Consortium. 20 Ocak 2022. 20 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 25 Ocak 2022. 
  54. ^ a b c "There's a new version of omicron but so far it doesn't appear to be more dangerous". Washington Post. 25 Ocak 2022. 25 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 25 Ocak 2022. 
  55. ^ "Enhancing response to Omicron SARS-CoV-2 variant: Technical brief and priority actions for Member States" (PDF). World Health Organization. 21 Ocak 2022. 24 Ocak 2022 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Ocak 2022. 
  56. ^ a b "COVID-19 Ukerapport – uke 2" (PDF) (Norveççe (Bokmål)). Norwegian Institute of Public Health. 19 Ocak 2022. 19 Ocak 2022 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 25 Ocak 2022. 
  57. ^ a b "Ny Omikron-variant tager over i Danmark - det ved vi om den" (Danca). TV2. 21 Ocak 2022. 22 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Ocak 2022. 
  58. ^ "Risikovurdering for udviklingen i epidemien med covid-19" (PDF) (Danca). Statens Serum Institut. 22 Ocak 2022. 27 Ocak 2022 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Ocak 2022. 
  59. ^ a b "COVID-19 variants identified in the UK". UK Health Security Agency. 21 Ocak 2022. 23 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Ocak 2022. 
  60. ^ "Omicron Covid variant poses very high global risk, says WHO". The Guardian. Londra. 29 Kasım 2021. 29 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 29 Kasım 2021. 
  61. ^ "What does appearance of Omicron variant mean for the double-vaccinated?". The Guardian. Londra. 29 Kasım 2021. 29 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 29 Kasım 2021. 
  62. ^ "Omicron: what do we know about the new Covid variant?". 5 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Ocak 2022. 
  63. ^ "Omicron extensively but incompletely escapes Pfizer BNT162b2 neutralization". Nature. December 2021. doi:10.1038/s41586-021-04387-1. PMID 35016196. 
  64. ^ "Omicron likely to weaken COVID vaccine protection". Nature. 600 (7889): 367-368. December 2021. doi:10.1038/d41586-021-03672-3. PMID 34880488. 21 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 4 Ocak 2022. 
  65. ^ CDC COVID-19 Response Team (December 2021). "SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) Variant - United States, December 1-8, 2021". MMWR. Morbidity and Mortality Weekly Report. Center for Disease Control. 70 (50): 1731-1734. doi:10.15585/mmwr.mm7050e1. PMC 8675659 $2. PMID 34914670. 20 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Aralık 2021. 
  66. ^ "New Covid variant: Will new measures against Omicron work?". 28 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Ocak 2022. 
  67. ^ "S. Africa expert: Previous infection doesn't protect against Omicron, but shots do". The Times of Israel (İngilizce). 2 Aralık 2021. 2 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 2 Aralık 2021. 
  68. ^ "LIVE - Covid: 'Staggering' Omicron case numbers expected - top health official". BBC News. 15 Aralık 2021. 22 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Aralık 2021. 
  69. ^ "Update on Omicron". World Health Organization. 28 Kasım 2021. 30 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 30 Kasım 2021. 
  70. ^ "Tshwane District Omicron Variant Patient Profile - Early Features". South African Medical Research Council. 4 Aralık 2021. 7 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Aralık 2021. 
  71. ^ "Omicron Wave Sees South Africa's Weekly Excess Deaths Almost Double". Bloomberg. 8 Aralık 2021. 19 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 11 Aralık 2021. 
  72. ^ "South Africa: previous infections may explain Omicron hospitalisation rate". The Guardian. 14 Aralık 2021. 20 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 14 Aralık 2021. 
  73. ^ "SARS-CoV-2 Viral Mutations: Impact on COVID-19 Tests". FDA. 16 Aralık 2021. 21 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 16 Aralık 2021. 
  74. ^ "SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England" (PDF). 18 Aralık 2021 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 10 Aralık 2021. 
  75. ^ "WHO names new COVID variant omicron, cautions against travel measures". Reuters. 26 Kasım 2021. 26 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Kasım 2021. 
  76. ^ "BioNTech says it could tweak Covid vaccine in 100 days if needed". The Guardian. 26 Kasım 2021. 27 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 27 Kasım 2021. 
  77. ^ "Novavax developing vaccine that targets new COVID-19 variant". CBS Baltimore Staff. 30 Kasım 2021. 2 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 4 Aralık 2021. 
  78. ^ "Maryland-Based Vaccine Manufacturer Developing COVID-19 Vaccine That Targets Omicron Variant". Reuters. 26 Kasım 2021. 28 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 30 Kasım 2021. 
  79. ^ "Sputnik V maker: Vaccine could be adapted to fight omicron". ABC News. Moskova. Associated Press. 29 Kasım 2021. 2 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 29 Kasım 2021. 
  80. ^ "Sinovac and world's Covid-19 vaccine makers 'ready' to produce Omicron jab". South China Morning Post. 29 Kasım 2021. 30 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 29 Kasım 2021. 
  81. ^ "Sinovac prevê atualização da Coronavac para variante Ômicron em até três meses" [Sinovac plans to update Coronavac to the Omicron variant within three months]. CNN Brazil (Portekizce). 7 Aralık 2021. 9 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 9 Aralık 2021. 
  82. ^ "Cuba to update domestic vaccine to battle Omicron". Al Jazeera. 2 Aralık 2021. 20 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Aralık 2021. 
  83. ^ "Omicron poses very high global risk, world must prepare -WHO". Reuters. Cenevre. 29 Kasım 2021. 30 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 30 Kasım 2021. 
  84. ^ "Pfizer shot provides partial omicron shield, study finds". The Japan Times. Bloomberg. 8 Aralık 2021. 8 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 8 Aralık 2021. 
  85. ^ "Early Lab Test Shows Omicron Weakening Vaccine Effectiveness". The Wall Street Journal. 7 Aralık 2021. 7 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Aralık 2021. 
  86. ^ "Omicron coronavirus variant partly evades Pfizer vaccine's protection, study shows". CNN. 7 Aralık 2021. 8 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Aralık 2021. 
  87. ^ "Coronavirus (COVID-19) booster vaccine". NHS. Government Digital Service. 17 Eylül 2021. 22 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 11 Aralık 2021. 
  88. ^ "Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern". WHO. 26 Kasım 2021. 26 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  89. ^ "Update on Omicron". World Health Organization. 28 Kasım 2021. 30 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  90. ^ "Interleukin-6 Receptor Antagonists in Critically Ill Patients with Covid-19". The New England Journal of Medicine. 384 (16): 1491-1502. April 2021. doi:10.1056/NEJMoa2100433. PMC 7953461 $2. PMID 33631065. 
  91. ^ "Omicron escapes the majority of existing SARS-CoV-2 neutralizing antibodies". Nature. December 2021. doi:10.1038/d41586-021-03796-6. PMID 35016194. 
  92. ^ "Broadly neutralizing antibodies overcome SARS-CoV-2 Omicron antigenic shift". bioRxiv. December 2021. doi:10.1038/d41586-021-03825-4. PMC 8687478 $2. PMID 34931194. 24 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 23 Aralık 2021. 
  93. ^ "Update on Omicron". World Health Organization. 28 Kasım 2021. 30 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 30 Kasım 2021. 
  94. ^ "SARS-CoV-2 reinfection trends in South Africa: analysis of routine surveillance data". medRxiv. January 2021. doi:10.1101/2021.11.11.21266068. 
  95. ^ "Omicron seems to carry higher Covid reinfection risk, says South Africa". The Guardian. 2 Aralık 2021. 3 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 3 Aralık 2021. 
  96. ^ "'Patience is crucial': Why we won't know for weeks how dangerous Omicron is". www.science.org. 30 Kasım 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 30 Kasım 2021. 
  97. ^ "Proportion and number of clades by epiweek in South Africa, 2021" (PDF). 26 Kasım 2021. 2 Aralık 2021 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 2 Aralık 2021. 
  98. ^ "Omicron becomes dominant variant in South Africa". The Guardian. 2 Aralık 2021. 2 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 2 Aralık 2021. 
  99. ^ "Risk assessment for SARS-CoV-2 variant: Omicron VOC-21NOV-01 (B.1.1.529): 3 December 2021" (PDF). GOV.UK. 4 Aralık 2021 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 4 Aralık 2021. 
  100. ^ "Wastewater-based epidemiology for SARS-CoV-2 in South Africa" (PDF). National Institute for Communicable Diseases. 9 Kasım 2021 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 30 Kasım 2021. 
  101. ^ "COVID-19: Toddlers make up 10% of hospital cases in South Africa's Omicron epicentre". gulfnews.com. 2 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 2 Aralık 2021. 
  102. ^ "Omicron Spread in South Africa". s. 6. 4 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 4 Aralık 2021. 
  103. ^ "Omicron Variant Spreading Twice as Quickly as Delta in South Africa". The New York Times (İngilizce). 4 Aralık 2021. ISSN 0362-4331. 4 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 4 Aralık 2021. 
  104. ^ The SARS-CoV-2 variant Omicron: a snapshot of where we are - 08.12.2021, 5 PM CET. (İngilizce), 21 Aralık 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi, erişim tarihi: 10 Aralık 2021 
  105. ^ "The puzzle of America's record Covid hospital rate". BBC News. 13 Ocak 2022. 14 Ocak 2022 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 14 Ocak 2022. 
  1. ^ With a presumed identical person-to-person serial interval of log_e(2.4)/0.21 ~ 4.2 days, or a distribution thereof to the same effect.