Fenerbahçe (basketbol takımı) 1958-59 sezonunda İstanbul Erkekler Basketbol Ligi'nde şampiyonluk şansını son iki maça kadar sürdürse de ligi üçüncü bitirdi.
Fenerbahçe Teşvik Turnuvasında ikinci olurken, sezon sonunda oynanan Bahar Kupası'nda şampiyon oldu (Darüşşafaka iki beraberlikle ikincilikte kaldı).
Sezon başında, 1957-63 arasında dört kez Polonya şampiyonu olan Legia Varşova'ya karşı alınan galibiyet nedeniyle Spor Oyunları Federasyonu Fenerbahçe'yi kutlamıştır.
Son hafta takımlar son iki maçlarını oynarken lig sıralamasına göre Modaspor, Fenerbahçe, Galatasaray ve Darüşşafaka şampiyonluk potasındaydı. Fenerbahçe'nin şampiyon olabilmesi için son iki maçını (Beykoz ve Galatasaray) kazanması, ayrıca dördüncü sırada olmakla birlikte şampiyonluk iddiası bulunan Darüşşafaka'nın da Modaspor'un yenmesi gerekmekteydi. Zira Modaspor ile Fenerbahçe'nin puan eşitliği halinde Modaspor şampiyon oluyordu (ilk yarıdaki maçı yedi sayı fartkla kazanan Modaspor'un rovanşı beş sayı farkla kazanabilen Fenerbahçe'ye ikili averajda +2 üstünlüğü vardı).
21 Şubat 1959 tarihinde Modaspor Darüşşafaka'yı yenince şampiyonluğu garantiledi. Böylece son gün Fenerbahçe-Galatasaray maçının şampiyonluk düğümünde hiçbir önemi kalmadı ve ikincilik-üçüncülük maçına dönüştü. Maçı kaybeden Fenerbahçe üçüncülüğe gerilerken, Lig ikincisi Galatasaray ile birlikte Federasyon Kupası'nın yolunu tuttu.
Genç takım üç sezon aradan sonra İstanbul şampiyonu oldu. Sarı-lacivertli takım 13-15 Mart 1959 tarihlerinde İstanbul'da düzenlenen Türkiye Gençler Basketbol Şampiyonası'nda İzmir Karantina’yı 59-27, Kırklareli’ni 64-23 ve Ankara Kolejliler’i 63-44 mağlup ederek tarihinde beşinci kez Türkiye şampiyonluğuna ulaştı.