İçeriğe atla

Rhodobacter capsulatus: Revizyonlar arasındaki fark

Vikipedi, özgür ansiklopedi
Etkileşimli olarak geçmişe göz at
[kontrol edilmemiş revizyon][kontrol edilmemiş revizyon]
← Önceki sürümle aradaki farkSonraki sürümle aradaki fark →
İçerik silindi İçerik eklendi
GörselVikimetin
Değişiklik özeti yok
Etiketler: Görsel Düzenleyici Mobil değişiklik Mobil ağ değişikliği
Değişiklik özeti yok
Etiketler: Görsel Düzenleyici Mobil değişiklik Mobil ağ değişikliği
22. satır: 22. satır:
==Ekoloji==
==Ekoloji==


Bu bakteri doğal su kaynakları veya kanalizasyon gibi sulu ortamları tercih eder. R. capsulatus ABD ve Küba'dan tecrit edilmiştir. Başlangıçta, bu bakteriler laboratuardan numunelerini RCVBN (DL-malik asit, amonyum sülfat, biyotin, nikotinik asit, eser elementler ve bazı ilave bileşikler) ortamına yerleştirerek ve anaerobik olarak bol ışıkla inkübasyon ile büyütülebilir. Bu plakalar üzerindeki koloniler daha sonra izole edilebilir, saf kültürde büyütülebilir ve R. capsulatus olarak tanımlanabilir. Genomunun dizilimi ile, RNA ve DNA dizilimi artık bu türü tanımlamak için kullanılabilir.
Bu bakteri doğal su kaynakları veya [[kanalizasyon]] gibi sulu ortamları tercih eder.<ref name="Molisch_1907" /><ref name="Weaver_1975">{{cite journal | vauthors = Weaver PF, Wall JD, Gest H | title = Characterization of Rhodopseudomonas capsulata | journal = Archives of Microbiology | volume = 105 | issue = 3 | pages = 207–16 | date = November 1975 | pmid = 1103769 | doi = 10.1007/BF00447139 }}</ref> R. capsulatus [[Amerika Birleşik Devletleri|ABD]] ve [[Küba|Küba'dan]] tecrit edilmiştir.<ref>{{cite book | vauthors = Pujalte MJ, Lucena T, Ruvira MA, Arahal DR, Macián MC |chapter=The Family Rhodobacteraceae|date=2014|doi= 10.1007/978-3-642-30197-1_377| title = The Prokaryotes|pages=439–512|publisher=Springer Berlin Heidelberg|isbn=978-3-642-30196-4 }}</ref> Başlangıçta, bu bakteriler laboratuardan numunelerini RCVBN ([[Malik asit|DL-malik asit]], [[amonyum sülfat]], [[biyotin]], [[nikotinik asit]], eser elementler ve bazı ilave bileşikler) ortamına yerleştirerek ve [[Oksijensiz solunum|anaerobik]] olarak bol ışıkla inkübasyon ile büyütülebilir. Bu plakalar üzerindeki koloniler daha sonra izole edilebilir, [[Saf kültür|saf kültürde]] büyütülebilir ve R. capsulatus olarak tanımlanabilir.<ref name="Weaver_1975" /> [[Genom|Genomunun]] dizilimi ile, [[RNA]] ve [[DNA]] dizilimi artık bu türü tanımlamak için kullanılabilir.<ref name="KEGG">{{cite web|title=KEGG GENOME: Rhodobacter capsulatus|url=http://www.genome.jp/kegg-bin/show_organism?org=rcp|website=Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes|access-date=8 December 2015}}</ref><ref name="Strnad_2010">{{cite journal | vauthors = Strnad H, Lapidus A, Paces J, Ulbrich P, Vlcek C, Paces V, Haselkorn R | title = Complete genome sequence of the photosynthetic purple nonsulfur bacterium Rhodobacter capsulatus SB 1003 | journal = Journal of Bacteriology | volume = 192 | issue = 13 | pages = 3545–6 | date = July 2010 | pmid = 20418398 | doi = 10.1128/JB.00366-10 | url = https://jb.asm.org/content/192/13/3545 }}</ref>


== Kaynakça ==
== Kaynakça ==

Sayfanın 15.54, 11 Mayıs 2020 tarihindeki hâli

Rhodobacter capsulatus
Biyolojik sınıflandırma
Âlem: Bacteria
Alt âlem: Proteobacteria
Sınıf: Alphaproteobacteria
Takım: Rhodobacterales
Familya: Rhodobacteraceae
Cins: ''Rhodobacter''
Tür: '''''R. capsulatus'''''
İkili adlandırma
''Rhodobacter capsulatus''
(Molisch 1907) Imhoff et al. 1984[1]
Sinonimler [2]

Rhodopseudomonas capsulata

Rhodobacter capsulatus, fotosentez yoluyla enerji elde edebilen bir grup bakteri olan mor bakteri türüdür.  Adı Latince sıfat "capsulatus" ("bir kafes ile", "kapsüllenmiş"), kendisi türetilmiş olan Latince isim "capsula" ("küçük bir kutu veya kafes" anlamına gelir) ve eril isimler için olan Latin son eki,  "-atus" (bir şeyin başka bir şeyle "sağlandığını" belirtir) üzerinden türetilmiştir.

Tam genomu dizilenmiştir ve halka açıktır.[3][4]

Keşif

Rhodobacter capsulatus'un keşfi, Çek-Avusturya botanikçisi Hans Molisch'e atfedilmektedir. Mikroorganizma daha sonralarda Rhodonostoc capsulatum olarak adlandırılmıştır ve 1907 yılında Die Purpurbakterien nach neuen Untersuchungen adlı kitabında tanımlanmıştır.[5] Daha sonra C. B. van Niel 1944'te Rhodopseudomonas capulata olarak yeniden isimlendirilen türü daha da karakterize etti. Van Niel başlangıçta Kaliforniya ve Küba'da toplanan çamur örneklerinden kültür alabildiği 16 R. capsulata suşunu tanımladı.[6] 1984 yılında türler, Rhodobacter cinsinin tanıtılmasıyla Rhodobacter capsulatus olarak yeniden sınıflandırılmıştır. Bu cins, Rhodopseudomonas cinsinin türlerini R. capsulatus ve R. sphaeroides gibi veziküler intrasitoplazmik membranları (hücrede sıklıkla fotosenteze dahil olan zara bağlı bölmeler)[7] olanlar gibi belirgin morfolojik farklılıklar ile daha iyi ayırt etmek için tanıtıldı.

Ekoloji

Bu bakteri doğal su kaynakları veya kanalizasyon gibi sulu ortamları tercih eder.[5][8] R. capsulatus ABD ve Küba'dan tecrit edilmiştir.[9] Başlangıçta, bu bakteriler laboratuardan numunelerini RCVBN (DL-malik asit, amonyum sülfat, biyotin, nikotinik asit, eser elementler ve bazı ilave bileşikler) ortamına yerleştirerek ve anaerobik olarak bol ışıkla inkübasyon ile büyütülebilir. Bu plakalar üzerindeki koloniler daha sonra izole edilebilir, saf kültürde büyütülebilir ve R. capsulatus olarak tanımlanabilir.[8] Genomunun dizilimi ile, RNA ve DNA dizilimi artık bu türü tanımlamak için kullanılabilir.[10][11]

Kaynakça

  1. ^ Imhoff, J. F.; Truper, H. G.; Pfennig, N. (1 Temmuz 1984). "Rearrangement of the Species and Genera of the Phototrophic "Purple Nonsulfur Bacteria"". International Journal of Systematic Bacteriology. 34 (3). ss. 340–343. doi:10.1099/00207713-34-3-340.  Geçersiz |doi-access=free (yardım)
  2. ^ "Rhodobacter capsulatus (Rhodopseudomonas capsulata)". UniProt. Erişim tarihi: 8 Aralık 2015. 
  3. ^ Strnad, H.; Lapidus, A.; Paces, J.; Ulbrich, P.; Vlcek, C.; Paces, V.; Haselkorn, R. (23 Nisan 2010). "Complete Genome Sequence of the Photosynthetic Purple Nonsulfur Bacterium Rhodobacter capsulatus SB 1003". Journal of Bacteriology. 192 (13). ss. 3545–3546. doi:10.1128/JB.00366-10. PMC 2897665 $2. PMID 20418398. 
  4. ^ "KEGG GENOME: Rhodobacter capsulatus". Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. Erişim tarihi: 8 Aralık 2015. 
  5. ^ a b Molisch H (1907). Die Purpurbakterien nach neuen Untersuchungen. 
  6. ^ van Niel CB (March 1944). "The Culture, General Physiology, Morphology, and Classification of the Non-Sulfur Purple and Brown Bacteria". Bacteriological Reviews. 8 (1). ss. 1–118. doi:10.1128/MMBR.8.1.1-118.1944. PMC 440875 $2. PMID 16350090. 
  7. ^ LaSarre B, Kysela DT, Stein BD, Ducret A, Brun YV, McKinlay JB (July 2018). "Restricted Localization of Photosynthetic Intracytoplasmic Membranes (ICMs) in Multiple Genera of Purple Nonsulfur Bacteria". mBio. 9 (4). doi:10.1128/mbio.00780-18. PMC 6030561 $2. PMID 29970460. 
  8. ^ a b Weaver PF, Wall JD, Gest H (November 1975). "Characterization of Rhodopseudomonas capsulata". Archives of Microbiology. 105 (3): 207–16. doi:10.1007/BF00447139. PMID 1103769. 
  9. ^ Pujalte MJ, Lucena T, Ruvira MA, Arahal DR, Macián MC (2014). "The Family Rhodobacteraceae". The Prokaryotes. Springer Berlin Heidelberg. ss. 439–512. doi:10.1007/978-3-642-30197-1_377. ISBN 978-3-642-30196-4. 
  10. ^ "KEGG GENOME: Rhodobacter capsulatus". Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. Erişim tarihi: 8 December 2015. 
  11. ^ Strnad H, Lapidus A, Paces J, Ulbrich P, Vlcek C, Paces V, Haselkorn R (July 2010). "Complete genome sequence of the photosynthetic purple nonsulfur bacterium Rhodobacter capsulatus SB 1003". Journal of Bacteriology. 192 (13): 3545–6. doi:10.1128/JB.00366-10. PMID 20418398. 
"https://tr.wikipedia.org/w/index.php?title=Rhodobacter_capsulatus&oldid=22414954" sayfasından alınmıştır