Pirolizin

Vikipedi, özgür ansiklopedi
09.57, 2 Kasım 2015 tarihinde Nanahuatl (mesaj | katkılar) tarafından oluşturulmuş 16239417 numaralı sürüm (Kategori:Amino asitler eklendi; {{kategorisiz}} kaldırıldı (HotCat))
Pirolizin
Adlandırmalar
N6-{[(2R,3R)-3-methyl-3,4-dihydro-2H-pyrrol-2-yl]carbonyl}-L-lysine
L-Pirolizin (yukarda) D-Pirolizin (aşağıda)
Tanımlayıcılar
3D model (JSmol)
ChemSpider
  • InChI=1/C12H21N3O3/c1-8-5-7-14-10(8)11(16)15-6-3-2-4-9(13)12(17)18/h7-10H,2-6,13H2,1H3,(H,15,16)(H,17,18)/t8-,9+,10-/m1/s1
  • O=C(NCCCC[C@@H](C(=O)O)N)[C@@H]1/N=C\C[C@H]1C
Özellikler
Molekül formülü C12H21N3O3
Molekül kütlesi 255,31 g·mol−1
Görünüm Katı
Tehlikeler
Güvenlik bilgi formu (SDS) ICSC 1507
Aksi belirtilmediği sürece madde verileri, Standart sıcaklık ve basınç koşullarında belirtilir (25 °C [77 °F], 100 kPa).
Bilgi kutusu kaynakları

Pirolizin Pyl ya da O şeklinde kısaltılır. Bu amino asit doğal olarak karşımıza çıkan genetik codlardan biri olup L-Lisinn’in türevlerindendir.

Pirolizin’in üç farlı sterogen merkezi vardır. Bunun anlamı yapısında bulunan karbon atomları dört faklı atom ya da molekülle bağ yapmıştır. Böylelikle sekiz izomeri blunmaktadır.

Diğer birçok amino asitte olduğu gibi bu amino asitin hem L- hemde D- isomeri vardır. Aber aktiv olan diğer bir değişle doğa var olan isomeri L- Pirolizin’dir. Buyüzden bu yazıda ya da bilimsel makalelerde Pirolizin L- ya da D- olarak hiçbir ön ek almayarak sadece Pirolizin diye bahsedilmişse, burada bahse geçen L- Pirolizin’dir

Pirolizin’in yapısında bulunan yan zincirlere lipofil denir.

Pirolizin daha çok doğada bakteriler tarafından sentzlenir ve bir enzimin yapısının yapısal parçası olarak kullanılmaktadır. Bu enzimler baktirelerin Metan döngüsüne işlemi sırsında kullanmaktadır. Bu amino asit ortamda bulunan özel bir gen frenkasıyla modfiye edilmiş UAG-Stop kodon tarafından kodlanır. Böylelikle Pyrrolysyl -tRNA ‚nın Ribosoma bağlanmasını sağlamaktadır

Kaynakça

  • Fournier, G. (2009): Horizontal gene transfer and the evolution of methanogenic pathways. In: Methods Mol Biol. 532; 163–179; PMID 19271184; doi:10.1007/978-1-60327-853-9_9
  • Srinivasan, G. et al. (2002): Pyrrolysine encoded by UAG in Archaea: charging of a UAG-decoding specialized tRNA. In: Science. 296(5572), S. 1459–1462 PMID 12029131 doi:10.1126/science.1069588
  • Hao, B. et al. (2002): A new UAG-encoded residue in the structure of a methanogen methyltransferase. In: Science. 296(5572), S. 1462–1466. PMID 12029132 doi:10.1126/science.1069556
  • Fenske, C. et al. (2003): Wie eindeutig ist der genetische Code? In: Angewandte Chemie. 115(6), S. 626–630. doi:10.1002/ange.200390142