APG III sistemi

Vikipedi, özgür ansiklopedi
Atla: kullan, ara
Kapalı tohumluların basitleştirilmiş filogenetik haritası (İspanyolca)

APG III sistemi, uzun adıyla "bitkilerde (Evrimsel Kapalı Tohumlu Gelişimi Topluluğu III sistemi)" bu topluluğun APG II sistemi sonrası bulunan yenilikler neticesi 2009'de ortaya çıkardığı, bu sistemin modifiye edilmiş üçüncü ve halen günümüz için geçerli bir versiyonudur. Bu sistem bu sefer modern teknik ve çoğunlukla moleküler filogenetik moleküler biyoloji den yararlanılarak ortaya çıkarılmış bir sınıflandırmadır. APG II siteminden 6,5 ve hepsinin atası APG Sistemi'nden 11 yıl sonra yapılan güncellemelerle sistem bugün geçerli 3. halini almıştır.[1][2][3]

Bu yeni sistemi açıklayan bu yayından hemen ardından 2 tane Botanical Journal of the Linnean Society dergisinin aynı sayısında takip eden makaleye yer verilmiştir. Bunlardan ilki Chase & Reveal adlı iki yazarca yayınlanan bütün kara bitkilerinin APG III sistemine göre resmi filogenetik sınıflandırılmasıdır. Linnaneas'ın mevcut sınıflandırması ile APG sistemi arasında bir uyum sağlama peşinde bir makaledir. Bütün kara bitkileri Equisitopsida sınıfına alınıp 16 alt sınıfa bölünmüştür. (İçinde bütün çiçekli bitkiler (Magnoliidae'de dahil) bulunmaktadır.[4] İkincisi Haston adlı bir botanist tarafından yazılan et al. adlı makaledir, APG III sistemine (LAPG III)göre ailelerin doğrusal sıralamalarını vermektedir. 413 kabul edilmiş aile ile ilgili olarak çeşitli bitki müzesi katılımcıları ve gönüllü flora çalışmalarının kullanılmasına onay veren kişilerin çalışmaları bir araya getirilip düzenlenilerek APG III sistemi dahilinde bu sıralamalar yapılmıştır.[5]

APG III sistemi hakkında genel bilgiler[değiştir | kaynağı değiştir]

The APG III sistemi eski APG II sistemindeki 45 Takım yanında 14 tanede yeni takım öngörmüştür. Yanlışlıkla diğer eski APG sistemlerinde yer alan Ceratophyllales yeni bir takımmış gibi lanse edilmiştir. Bu hata haricinde sınıflandırmada geçen yeni takım adları şunlardır:

Amborellales, Nymphaeales, Chloranthales, Petrosaviales, Trochodendrales, Buxales, Vitales, Zygophyllales, Picramniales, Huerteales, Berberidopsidales, Escalloniales, Bruniales ve Paracryphiales.

Alternatif opsiyonel parantez familya uygulaması APG III sisteminde terk edilmiştir zira önceki sistemde bu alternatif familyalar pek ilgi görmemiştir. APG III 413 familyayı tanır ve bu önceki sistemden 44 adet eksiktir, 55 parantez familya uygulamasına son verildiği gibi 18 familya adı da artık kullanılmamak üzere kaldırılmıştır.

Artık devam etmeyen parantez familyalar:

Illiciaceae, Alliaceae, Agapanthaceae, Agavaceae, Aphyllanthaceae, Hesperocallidaceae, Hyacinthaceae, Laxmanniaceae, Ruscaceae, Themidaceae, Asphodelaceae, Hemerocallidaceae, Kingdoniaceae, Fumariaceae, Pteridophyllaceae, Didymelaceae, Tetracentraceae, Pterostemonaceae, Hypseocharitaceae, Francoaceae, Memecylaceae, Lepuropetalaceae, Rhoipteleaceae, Medusagynaceae, Quiinaceae, Malesherbiaceae, Turneraceae, Bretschneideraceae, Diegodendraceae, Cochlospermaceae, Peganaceae, Tetradiclidaceae, Nyssaceae, Ternstroemiaceae, Pellicieraceae, Aucubaceae, Donatiaceae, Lobeliaceae, Desfontainiaceae, Diervillaceae, Dipsacaceae, Linnaeaceae, Morinaceae, ve Valerianaceae.

Artık sistemde yer verilmeyen sınıflandırmadan tamamen çıkarılan 18 familya :

Limnocharitaceae, Luzuriagaceae, Sparganiaceae, Ledocarpaceae, Heteropyxidaceae, Psiloxylaceae, Oliniaceae, Rhynchocalycaceae, Parnassiaceae, Maesaceae, Myrsinaceae, Theophrastaceae, Eremosynaceae, Polyosmaceae, Tribelaceae, Aralidiaceae, Mackinlayaceae, ve Melanophyllaceae.

Eski 2 sistemde de bulunmayan 19 yeni familyaya ise APG III sistemi yer vermiştir az miktardaki familyalar ise farklı yerlere alınarak yeri değiştirilmiştir. sitemdeki yeni familyalar:Petermanniaceae, Schoepfiaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae, Talinaceae, Anacampserotaceae, Centroplacaceae, Calophyllaceae, Guamatelaceae, Gerrardinaceae, Dipentodontaceae, Capparidaceae, Cleomaceae, Cytinaceae, Mitrastemonaceae, Metteniusaceae, Linderniaceae, ve Thomandersiaceae.

Hiçbir takımda bulunmayan familya sayısı 39'dan 10'a düşürülmüştür ve Kapalı tohumlular ile incertae sedis(Latince kelimedir.Türkçesi: Emin olunamayan yerleştirme-sıralama), arasına Apodanthaceae ve Cynomoriaceae adlı kapalı tohumlularda yeri belirsiz 2 ayrı familya konulmuştur. Kalan 8 tane familya ise incertae sedis olarak çeşitli kapalı tohumlular takım gruplarına dağıtılmıştır. Yeri belirsiz familyalar:

Apodanthaceae, Cynomoriaceae, Dasypogonaceae, Sabiaceae, Dilleniaceae, Icacinaceae, Metteniusaceae, Oncothecaceae, Vahliaceae, ve Boraginaceae dir.

Icacinaceae familyasının taksonomik sınırlaması hala belirsizliğini korumaktadır; Apodytes, Emmotum, Cassinopsis ve az miktarda bir kısım cins bundan sonraki bilimsel çalışmalar nereye ait olduğunu tespit edene kadar geçici olarak bu familya içine konmuştur.

3 cins (Gumillea (APG siteminde vardı;APG II sisteminde kaldırılmıştı şimdi tekrar konuldu) ve Nicobariodendron ile Petenaea) (bunlar ise yeni eklendi) incertae sedis olarak kapalı tohumlularda yer verildi. Ancak bu yayınlardan sonra Petenaea için Petenaeaceae adlı kendi familyası oluşturularak uzaktan yakınlığı saptanan Huerteales takımına alındı.[6][7]

2 model halinde bu sınıflandırma gösterilmiştir. Özet modellemede sadece dal (klad) ve takımlar gösterilmiştir. Detaylı modelde ise alfabetik sıralama ile takımlar ve familyalar detaylı gösterilmiştir. Kalan detaylar için aşağıda gösterilen filogenetik ağaca bakın.

Özet Model[değiştir | kaynağı değiştir]

Ayrıntılı Model (bütün familyalar ile birlikte)[değiştir | kaynağı değiştir]

Lale çiçeği, Monocots (Bir çenekliler) dalı,Liliales takımı, Liliaceae (Zambakgiller) familyası, Tulipa cinsindendir.
Magnolia watsoni çiçeği,Magnoliids dalı içinde,Magnoliales takımı üyesi.
Lilium henryi çiçeği, Bir çenekliler dalında,Liliales takımı üyesi .
Oxalis regnellii çiçeği,fabids dalı içinde oxalidales takımı üyesi.
Büyük ebegümeci çiçeği,malvids dalı içinde malvales takımı üyesi.
Lavanta çiçeği, lámiids dalı lamiales takımı üyesi.
Yıldızpatı çiçekleri,asterids dalından campanulids dalı asterales takımı Asteraceae familyası üyesidir.

İşaretler: * = Yeni familya yerleştirmeleri
= APG sisteminde yeni tanınan takım;
§ = metinde belirtilen yeni familyalarr;
$ = APG II sistemi içinde daha geniş kapsamlı kullanılabilirlik seçeneği mevcut aileler tercih edilmiştir;
$$ = kare parantez içinde APG II sistemi içindeki familyaların yakınındaki derecelendirmeler tercih edilmiştir.

Angiosperms (Kapalı tohumlular)[değiştir | kaynağı değiştir]

Magnoliids[değiştir | kaynağı değiştir]

Monocots (Tek çenekliler)[değiştir | kaynağı değiştir]

Commelinids[değiştir | kaynağı değiştir]

iki çeneklilerin muhtemelen kardeşi (probable sister of eudicots)[değiştir | kaynağı değiştir]

Eudicots (İki çenekliler)[değiştir | kaynağı değiştir]

Core eudicots(Gerçek İki Çenekliler)[değiştir | kaynağı değiştir]

Rosids[değiştir | kaynağı değiştir]

Eurosids I[değiştir | kaynağı değiştir]

Eurosids II[değiştir | kaynağı değiştir]

Asterids[değiştir | kaynağı değiştir]

Euasterids I[değiştir | kaynağı değiştir]

Euasterids II[değiştir | kaynağı değiştir]

Durumu Belirsiz Sıralamalar[değiştir | kaynağı değiştir]

Filojen[değiştir | kaynağı değiştir]

The APG III sistemi kapalı tohumlular için 59 takım ve 4 yer verilmemiş aileden oluşan finogenetik bir ağacı baz alır. Diğer 6 yeri belirsiz yerleştirme yapılmış aileye ise bu belirsiz konumdan ötürü ağacın polytomlerinde yer verilmez. Ayrıntılı modelleme üsttedir.

Aşağıdaki filogenetik ağaç APG III sistemine göre hazırlanıp yayınlanmıştır.[1] fakat bir kısım etiketlemeler buraya eklenmemiştir.

angiosperms 

Amborellales




Nymphaeales




Austrobaileyales


mesangiosperms 


Chloranthales


magnoliids 


Canellales



Piperales





Magnoliales



Laurales






monocots 

Acorales




Alismatales




Petrosaviales





Dioscoreales



Pandanales





Liliales




Asparagales


commelinids 

Dasypogonaceae



Arecales



Poales




Commelinales



Zingiberales












Ceratophyllales


eudicots 

Ranunculales




Sabiaceae



Proteales




Trochodendrales



Buxales


core eudicots 

Gunnerales




Dilleniaceae




Saxifragales


rosids 

Vitales


eurosids 
fabids 

Zygophyllales





Celastrales




Oxalidales



Malpighiales






Fabales




Rosales




Fagales



Cucurbitales







malvids 


Geraniales



Myrtales





Crossosomatales




Picramniales




Sapindales




Huerteales




Brassicales













Berberidopsidales




Santalales




Caryophyllales


asterids 

Cornales




Ericales


euasterids 
lamiids 

Garryales




Boraginaceae



Gentianales




Solanales



Lamiales






campanulids*



















Campanulids (devamı)[değiştir | kaynağı değiştir]

*campanulids 

Aquifoliales




Asterales



Escalloniales




Bruniales




Apiales




Paracryphiales



Dipsacales







APG III'de kaldırılan bazı parantez familyalar ve bunların alt familya olarak kullanılabileceği yerler.[değiştir | kaynağı değiştir]

Bir kısım APG II sisteminde belirtilen parantez familyalara APG III sisteminde yer verilmemiştir ancak alt familya olarak bu familyalar istenirse gösterilebilir..[8] Bunlar aşağıda gösterilmiştir.

APG III içinde bir familya içindeki alt familyalarr; APG II parantez familyaların yerini almıştır.
APG II parantez familyaları APG III familyaları: alt familyalar
Agapanthaceae Amaryllidaceae: Agapanthoideae
Agavaceae Asparagaceae: Agavoideae
Alliaceae Amaryllidaceae: Allioideae
Amaryllidaceae Amaryllidaceae: Amaryllidoideae
Aphyllanthaceae Asparagaceae: Aphyllanthoideae
Asparagaceae Asparagaceae: Asparagoideae
Asphodelaceae Xanthorrhoeaceae: Asphodeloideae
Hemerocallidaceae Xanthorrhoeaceae: Hemerocallidoideae
Hesperocallidaceae Asparagaceae: Agavoideae
Hyacinthaceae Asparagaceae: Scilloideae
Laxmanniaceae Asparagaceae: Lomandroideae
Ruscaceae Asparagaceae: Nolinoideae
Themidaceae Asparagaceae: Brodiaeoideae
Xanthorrhoeaceae Xanthorrhoeaceae: Xanthorrhoeoideae

Kaynaklar[değiştir | kaynağı değiştir]

  1. ^ a b Angiosperm Phylogeny Group (2009), "An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG III", Botanical Journal of the Linnean Society 161 (2): 105–121, doi:10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x, http://www3.interscience.wiley.com/journal/122630309/abstract 
  2. ^ As easy as APG III - Scientists revise the system of classifying flowering plants, The Linnean Society of London, 2009-10-08, http://www.linnean.org/index.php?id=448 
  3. ^ APG III tidies up plant family tree, Horticulture Week, 08-10-2009, http://www.hortweek.com/channel/OrnamentalsProduction/rss/article/943975/APG-III-tidies-plant-family-tree/ 
  4. ^ Mark W.Chase-James L.Reveal (2009), "A phylogenetic classification of the land plants to accompany APG III", Botanical Journal of the Linnean Society 161 (2): 122–127, doi:10.1111/j.1095-8339.2009.01002.x 
  5. ^ Haston, E., Richardson, J.E., Stevens, P.F., Chase, M.W., Harris, D.J. (2009) The Linear Angiosperm Phylogeny Group (LAPG) III: a linear sequence of the families in APG III. Botanical Journal of the Linnean Society 161, 128–131.
  6. ^ Christenhusz, M. J. M., M. F. Fay, J. J. Clarkson, P. Gasson, J. Morales Can, J. B. Jimenez Barrios & M. W. Chase (2010). Petenaeaceae, a new angiosperm family in Huerteales with a distant relationship to Gerrardina (Gerrardinaceae), Botanical Journal of the Linnean Society 164: 16-25. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1095-8339.2010.01074.x/abstract
  7. ^ Christenhusz, M. J. M., M. W. Chase, & M.F.Fay (2011). Preface to "Linear sequence, classification, synonymy, and bibliography of vascular plants: Lycophytes, ferns, gymnosperms and angiosperms", Phytotaxa 19: 4–6. http://www.mapress.com/phytotaxa/content/2011/f/pt00019p006.pdf
  8. ^ Chase, M.W.; Reveal, J.L. & Fay, M.F. (2009), "A subfamilial classification for the expanded asparagalean families Amaryllidaceae, Asparagaceae and Xanthorrhoeaceae", Botanical Journal of the Linnean Society 161 (2): 132–136, doi:10.1111/j.1095-8339.2009.00999.x 

Ayrıca bakınız[değiştir | kaynağı değiştir]

Dış bağlantılar[değiştir | kaynağı değiştir]